De directie van de NVWA bestaat uit de inspecteur-generaal en de directeuren.
Inspecteur-generaal dr. mr. G.J.C.M. (Gerard) Bakker 
Directeur Slachttoezicht G. (Geert) Moelker Directeur Strategie mr. J.P.G. (Pauline) den Ambtman 
Waarnemend directeur Interne organisatie drs. R.G.M. (Regine) Doornbos-Neyt Directeur Handhaven drs. F.G. (Esmeralda) Wallast Groenewoud 
Directeur Handelstoezicht ir. E. (Edwin) Lakerveld